Forstørrelsen af et biologisk mikroskop er typisk lav, der spænder fra 40x til 1000x. Dette skyldes, at biologiske prøver normalt er gennemsigtige og kræver moderat forstørrelse for at observere strukturerne af celler og væv.
I et biologisk mikroskop bestemmes forstørrelsen af kombinationen af objektivlinsen og okularet. Almindelige objektivlinseforstørrelser omfatter 4x, 10x, 40x og 100x, mens okularet typisk har en forstørrelse på 10x. Derfor er den maksimale forstørrelse af et typisk biologisk mikroskop 100x objektiv ganget med 10x okular, hvilket svarer til 1000x.
Det er vigtigt at bemærke, at forstørrelsen af et biologisk mikroskop ikke er så høj som for et elektronmikroskop, fordi biologiske prøver ofte er komplekse i struktur, og observationsprocessen kræver, at prøvernes levedygtighed og integritet opretholdes. Derudover er opløsningen af et biologisk mikroskop også afgørende, da biologiske strukturer ofte er meget små og kræver høj opløsning for at observere fine detaljer.
I visse specialiserede applikationer, der kræver højere forstørrelse, såsom patologisk forskning eller mikrokirurgi, kan okular med højere forstørrelse (f.eks. 16x eller højere) bruges i kombination med passende okularer for at opnå højere forstørrelse. Disse observationer med høj forstørrelse kræver dog normalt mere komplekse prøveforberedelse og mikroskopiteknikker og kræver større dygtighed fra operatøren.